Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Ad-Aware admite al menos 2 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Ad-Aware son .BCKP. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Ad-Aware. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Ad-Aware.
Ad-Aware se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Ad-Aware e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Ad-Aware.