Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Daring Fireball Markdown admite al menos 2 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Daring Fireball Markdown son .MD. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Daring Fireball Markdown. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Daring Fireball Markdown.
Daring Fireball Markdown se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Daring Fireball Markdown e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Daring Fireball Markdown.