Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. E-Prime admite al menos 4 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite E-Prime son .ES. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en E-Prime. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por E-Prime.
E-Prime se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de E-Prime e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con E-Prime.