Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Halo Custom Edition admite al menos 1 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Halo Custom Edition son .KSML. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Halo Custom Edition. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Halo Custom Edition.
Halo Custom Edition se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Halo Custom Edition e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Halo Custom Edition.