Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. iPhone Configuration Utility admite al menos 4 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite iPhone Configuration Utility son .MOBILECONFIG. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en iPhone Configuration Utility. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por iPhone Configuration Utility.
iPhone Configuration Utility se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de iPhone Configuration Utility e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con iPhone Configuration Utility.