Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Quake 4 admite al menos 5 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Quake 4 son .SAVE. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Quake 4. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Quake 4.
Quake 4 se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Quake 4 e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Quake 4.