Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Tools E-Prime admite al menos 7 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Tools E-Prime son .EDAT. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Tools E-Prime. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Tools E-Prime.
Tools E-Prime se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Tools E-Prime e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Tools E-Prime.