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Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Zoo Tycoon 2 admite al menos 3 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Zoo Tycoon 2 son .DL. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Zoo Tycoon 2. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Zoo Tycoon 2.
Zoo Tycoon 2 se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Zoo Tycoon 2 e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Zoo Tycoon 2.