Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. MS-DOS admite al menos 39 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite MS-DOS son .EXE. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en MS-DOS. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por MS-DOS.
MS-DOS se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de MS-DOS e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con MS-DOS.