Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Total Commander admite al menos 43 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Total Commander son .LNG. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Total Commander. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Total Commander.
Total Commander se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Total Commander e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Total Commander.