Por defecto, todo el software admite múltiples extensiones de archivo. Virtual CD admite al menos 14 extensiones de archivo diferentes. Los archivos básicos que admite Virtual CD son .MDF. Sin embargo, no todas las extensiones enumeradas en la lista siempre se usan para guardar los efectos del trabajo en Virtual CD. Muy a menudo, los archivos con tales extensiones se utilizan como archivos de datos de origen utilizados por Virtual CD.
Virtual CD se puede usar para convertir formatos de archivo entre las extensiones de archivo que se enumeran a continuación. Puede abrir un archivo con una de las extensiones de archivo a continuación a través de Virtual CD e intentar guardarlo en otro formato de archivo, también compatible con Virtual CD.